检察院批捕后，案件通常按以下流程进行：

首先是侦查阶段，公安机关继续侦查，期限一般为2个月，复杂案件可经上一级检察院批准延长1个月。特殊重大复杂案件还能进一步延长。

侦查终结后，案件进入审查起诉阶段。公安机关会将案件移送检察院，检察院在1个月内作出是否起诉的决定，重大、复杂案件可延长15日。若认为证据不足，可退回公安机关补充侦查，以2次为限，每次期限1个月，补充侦查完毕后重新计算审查起诉期限。

最后是审判阶段。若检察院决定起诉，会向法院提起公诉，法院受理后会安排开庭审理。适用简易程序审理的案件，应在受理后20日内审结；适用普通程序的案件，一般在受理后2个月内宣判，至迟不超3个月。
检察院批捕后，案件进入侦查羁押阶段。一般情况下，侦查机关对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可经上一级人民检察院批准延长一个月。

侦查终结后，侦查机关会将案件移送至检察院审查起诉。检察院应在一个月内作出决定，重大、复杂案件可延长十五日。若犯罪嫌疑人认罪认罚，符合速裁程序适用条件的，应在十日以内作出决定，对可能判处的有期徒刑超过一年的，可以延长至十五日。

审查起诉时，若检察院认为证据不足，可退回侦查机关补充侦查，以二次为限，每次补充侦查期限为一个月。补充侦查完毕移送检察院后，重新计算审查起诉期限。最终，检察院认为犯罪事实清楚、证据确实充分，会向法院提起公诉，进入审判阶段。